Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC00116Q8NCU8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LINC00116Q8NCU8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms