Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC191Q8NCU4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC191Q8NCU4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC191Q8NCU4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms