Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms