Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC83Q8IWF9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms