Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3FQ8IUX4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
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