Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms