Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM220Q6QAJ8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM220Q6QAJ8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms