Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LARP1Q6PKG0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms