Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A1Q6PCB7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms