Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms