Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INTS3Q68E01 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
INTS3Q68E01 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
INTS3Q68E01 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
INTS3Q68E01 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
INTS3Q68E01 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
INTS3Q68E01 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
INTS3Q68E01 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
INTS3Q68E01 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
INTS3Q68E01 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
INTS3Q68E01 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
INTS3Q68E01 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
INTS3Q68E01 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
INTS3Q68E01 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
INTS3Q68E01 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INTS3Q68E01 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INTS3Q68E01 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INTS3Q68E01 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INTS3Q68E01 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
INTS3Q68E01 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.56■■■□□ 2
INTS3Q68E01 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
INTS3Q68E01 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INTS3Q68E01 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
INTS3Q68E01 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INTS3Q68E01 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INTS3Q68E01 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INTS3Q68E01 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
INTS3Q68E01 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
INTS3Q68E01 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
INTS3Q68E01 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms