Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM1

AFMID, Kynurenine formamidase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMIDQ63HM1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFMIDQ63HM1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFMIDQ63HM1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms