Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms