Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATAD3BQ5T9A4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms