Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDLRAD1Q5T700 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms