Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms