Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CT47A1Q5JQC4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms