Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR4Q5GH76 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR4Q5GH76 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR4Q5GH76 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms