Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms