Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms