Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TAF9Q16594 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms