Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
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