Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA4Q16363 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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