Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms