Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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