Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX17Q15036 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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