Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM2Q15035 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM2Q15035 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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