Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD6Q15008 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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