Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCINQ13939 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCINQ13939 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCINQ13939 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCINQ13939 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCINQ13939 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCINQ13939 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCINQ13939 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCINQ13939 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCINQ13939 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCINQ13939 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCINQ13939 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCINQ13939 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCINQ13939 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCINQ13939 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCINQ13939 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCINQ13939 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCINQ13939 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCINQ13939 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCINQ13939 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCINQ13939 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCINQ13939 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCINQ13939 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCINQ13939 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCINQ13939 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCINQ13939 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCINQ13939 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCINQ13939 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCINQ13939 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCINQ13939 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCINQ13939 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCINQ13939 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCINQ13939 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCINQ13939 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCINQ13939 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCINQ13939 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCINQ13939 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCINQ13939 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCINQ13939 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCINQ13939 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCINQ13939 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCINQ13939 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCINQ13939 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCINQ13939 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCINQ13939 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCINQ13939 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCINQ13939 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCINQ13939 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCINQ13939 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCINQ13939 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCINQ13939 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCINQ13939 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCINQ13939 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCINQ13939 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCINQ13939 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCINQ13939 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCINQ13939 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCINQ13939 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCINQ13939 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCINQ13939 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCINQ13939 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCINQ13939 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCINQ13939 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCINQ13939 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCINQ13939 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCINQ13939 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCINQ13939 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCINQ13939 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCINQ13939 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCINQ13939 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCINQ13939 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCINQ13939 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCINQ13939 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCINQ13939 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCINQ13939 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCINQ13939 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCINQ13939 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCINQ13939 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCINQ13939 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCINQ13939 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCINQ13939 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCINQ13939 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCINQ13939 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCINQ13939 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCINQ13939 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCINQ13939 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCINQ13939 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCINQ13939 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCINQ13939 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCINQ13939 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCINQ13939 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCINQ13939 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCINQ13939 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCINQ13939 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCINQ13939 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCINQ13939 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCINQ13939 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCINQ13939 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCINQ13939 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCINQ13939 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms