Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRQ13535 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRQ13535 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRQ13535 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATRQ13535 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRQ13535 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms