Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL49Q13405 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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