Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3B2Q13367 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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