Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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