Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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