Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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