Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY3A-G	Q12173	RNR1	YER070W	2667 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	OPI6	YDL096C	327 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	AGE2	YIL044C	897 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	YKR047W	YKR047W	306 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	SRP40	YKR092C	1221 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	YLR156W	YLR156W	345 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	YLR159W	YLR159W	345 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	YLR161W	YLR161W	345 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	YML053C	YML053C	639 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	YMR122W-A	YMR122W-A	255 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	IDH2	YOR136W	1110 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	FSH3	YOR280C	801 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	ACK1	YDL203C	1872 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	CNA1	YLR433C	1662 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	HOS2	YGL194C	1359 nt		3.93	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	REC104	YHR157W	549 nt		3.93	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	PLP2	YOR281C	861 nt		3.93	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	SMF1	YOL122C	1728 nt		3.92	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	FAT1	YBR041W	2010 nt		3.92	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	SPS2	YDR522C	1509 nt		3.92	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	SRP72	YPL210C	1923 nt		3.92	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	YGR015C	YGR015C	987 nt		3.92	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	IRC9	YJL142C	393 nt		3.92	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	ECM4	YKR076W	1113 nt		3.92	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	ARG80	YMR042W	534 nt		3.92	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	YNL067W-A	YNL067W-A	147 nt		3.92	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	FDH2	YPL275W	711 nt		3.92	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	TIM12	YBR091C	330 nt		3.92	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	EMC1	YCL045C	2283 nt		3.92	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	NPL4	YBR170C	1743 nt		3.92	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	NCR1	YPL006W	3513 nt		3.92	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	SEA4	YBL104C	3117 nt		3.92	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	APL4	YPR029C	2499 nt		3.92	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	NKP1	YDR383C	717 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	tK(UUU)D	tK(UUU)D	73 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	tK(UUU)G1	tK(UUU)G1	73 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	FMP10	YER182W	735 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	tK(UUU)G2	tK(UUU)G2	73 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	tK(UUU)K	tK(UUU)K	73 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	tK(UUU)L	tK(UUU)L	73 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	tK(UUU)O	tK(UUU)O	73 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	tK(UUU)P	tK(UUU)P	73 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	COS12	YGL263W	1143 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	YGR051C	YGR051C	324 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	YHI9	YHR029C	885 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	COX2	Q0250	756 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	PTM1	YKL039W	1572 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	RPL18A	YOL120C	561 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	NAM9	YNL137C	1461 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	HPR1	YDR138W	2259 nt		3.91	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	RRN6	YBL014C	2685 nt		3.9	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	YBR138C	YBR138C	1575 nt		3.9	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	NSA2	YER126C	786 nt		3.9	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	YHR180W	YHR180W	492 nt		3.9	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	GCD14	YJL125C	1152 nt		3.9	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	CDC8	YJR057W	651 nt		3.9	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	FOL3	YMR113W	1284 nt		3.9	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	VAS1	YGR094W	3315 nt		3.9	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	MNR2	YKL064W	2910 nt		3.9	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	NUP85	YJR042W	2235 nt		3.9	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	LCB5	YLR260W	2064 nt		3.9	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	TRM13	YOL125W	1431 nt		3.89	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	NAT1	YDL040C	2565 nt		3.89	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	YCL075W	YCL075W	441 nt		3.89	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	SPO12	YHR152W	522 nt		3.89	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	ADD66	YKL206C	804 nt		3.89	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	APC9	YLR102C	798 nt		3.89	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		3.89	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	MCM7	YBR202W	2538 nt		3.89	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	TAF6	YGL112C	1551 nt		3.89	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	BUD6	YLR319C	2367 nt		3.88	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	YIL092W	YIL092W	1902 nt		3.88	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	SNL1	YIL016W	480 nt		3.88	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	RSM25	YIL093C	795 nt		3.88	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	MBB1	YJL199C	327 nt		3.88	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	VPS71	YML041C	843 nt		3.88	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	PEX12	YMR026C	1200 nt		3.88	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	OCA1	YNL099C	717 nt		3.88	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	UTP23	YOR004W	765 nt		3.88	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	DER1	YBR201W	636 nt		3.88	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	NTH1	YDR001C	2256 nt		3.88	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	RPB2	YOR151C	3675 nt		3.88	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	RPS13	YDR064W	456 nt		3.87	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	YER034W	YER034W	558 nt		3.87	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	MOB2	YFL034C-B	864 nt		3.87	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	YAL064W-B	YAL064W-B	381 nt		3.87	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	OCA2	YNL056W	594 nt		3.87	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	SMP3	YOR149C	1551 nt		3.87	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	CLD1	YGR110W	1338 nt		3.87	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	MSD1	YPL104W	1977 nt		3.87	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	MNL1	YHR204W	2391 nt		3.87	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	MLH2	YLR035C	2088 nt		3.86	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	ERB1	YMR049C	2424 nt		3.86	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	RSC1	YGR056W	2787 nt		3.86	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	PFA5	YDR459C	1125 nt		3.86	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	RFC3	YNL290W	1023 nt		3.86	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	OSW1	YOR255W	837 nt		3.86	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	SPT16	YGL207W	3108 nt		3.86	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	ISW2	YOR304W	3363 nt		3.86	□□□□□ -1.79
TY3A-G	Q12173	IOC2	YLR095C	2439 nt		3.85	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.4 ms