Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms