Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms