Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms