Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms