Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3AQ05086 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms