Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms