Protein–RNA interactions for Protein: P78560

CRADD, Death domain-containing protein CRADD, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRADDP78560 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRADDP78560 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRADDP78560 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRADDP78560 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRADDP78560 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRADDP78560 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRADDP78560 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRADDP78560 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRADDP78560 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRADDP78560 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRADDP78560 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRADDP78560 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRADDP78560 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRADDP78560 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRADDP78560 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRADDP78560 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRADDP78560 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRADDP78560 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRADDP78560 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRADDP78560 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRADDP78560 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRADDP78560 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRADDP78560 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRADDP78560 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRADDP78560 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRADDP78560 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRADDP78560 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRADDP78560 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRADDP78560 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRADDP78560 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRADDP78560 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRADDP78560 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRADDP78560 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRADDP78560 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRADDP78560 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRADDP78560 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRADDP78560 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRADDP78560 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRADDP78560 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRADDP78560 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRADDP78560 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRADDP78560 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRADDP78560 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRADDP78560 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRADDP78560 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRADDP78560 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRADDP78560 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRADDP78560 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRADDP78560 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRADDP78560 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRADDP78560 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRADDP78560 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRADDP78560 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRADDP78560 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRADDP78560 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRADDP78560 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRADDP78560 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRADDP78560 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRADDP78560 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRADDP78560 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRADDP78560 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRADDP78560 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRADDP78560 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRADDP78560 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRADDP78560 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRADDP78560 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRADDP78560 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRADDP78560 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRADDP78560 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRADDP78560 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRADDP78560 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRADDP78560 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRADDP78560 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRADDP78560 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRADDP78560 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRADDP78560 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRADDP78560 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRADDP78560 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRADDP78560 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRADDP78560 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRADDP78560 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRADDP78560 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRADDP78560 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRADDP78560 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRADDP78560 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRADDP78560 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRADDP78560 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRADDP78560 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRADDP78560 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRADDP78560 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRADDP78560 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRADDP78560 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRADDP78560 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRADDP78560 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRADDP78560 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRADDP78560 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRADDP78560 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRADDP78560 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRADDP78560 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRADDP78560 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms