Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP46P62068 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP46P62068 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP46P62068 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP46P62068 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP46P62068 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP46P62068 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP46P62068 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP46P62068 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP46P62068 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP46P62068 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP46P62068 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP46P62068 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP46P62068 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP46P62068 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP46P62068 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP46P62068 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP46P62068 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP46P62068 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP46P62068 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP46P62068 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP46P62068 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP46P62068 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP46P62068 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP46P62068 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP46P62068 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP46P62068 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP46P62068 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP46P62068 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP46P62068 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP46P62068 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP46P62068 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP46P62068 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP46P62068 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP46P62068 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP46P62068 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP46P62068 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP46P62068 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP46P62068 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP46P62068 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP46P62068 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP46P62068 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP46P62068 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP46P62068 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP46P62068 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP46P62068 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP46P62068 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP46P62068 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP46P62068 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP46P62068 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP46P62068 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP46P62068 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP46P62068 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP46P62068 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP46P62068 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP46P62068 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP46P62068 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP46P62068 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP46P62068 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP46P62068 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP46P62068 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP46P62068 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP46P62068 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP46P62068 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP46P62068 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP46P62068 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP46P62068 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP46P62068 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP46P62068 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP46P62068 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP46P62068 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP46P62068 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP46P62068 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP46P62068 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP46P62068 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP46P62068 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP46P62068 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP46P62068 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP46P62068 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP46P62068 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP46P62068 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP46P62068 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP46P62068 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP46P62068 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP46P62068 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP46P62068 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP46P62068 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP46P62068 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP46P62068 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP46P62068 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP46P62068 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP46P62068 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP46P62068 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP46P62068 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP46P62068 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP46P62068 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP46P62068 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP46P62068 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP46P62068 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP46P62068 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms