Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS2P61201 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS2P61201 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS2P61201 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS2P61201 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS2P61201 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS2P61201 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS2P61201 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS2P61201 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS2P61201 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS2P61201 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS2P61201 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS2P61201 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS2P61201 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS2P61201 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS2P61201 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS2P61201 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS2P61201 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS2P61201 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS2P61201 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS2P61201 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS2P61201 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS2P61201 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS2P61201 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS2P61201 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS2P61201 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS2P61201 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS2P61201 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS2P61201 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS2P61201 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS2P61201 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS2P61201 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS2P61201 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS2P61201 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS2P61201 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS2P61201 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS2P61201 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS2P61201 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS2P61201 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS2P61201 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS2P61201 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS2P61201 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS2P61201 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS2P61201 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS2P61201 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS2P61201 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS2P61201 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS2P61201 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS2P61201 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS2P61201 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS2P61201 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS2P61201 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS2P61201 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS2P61201 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS2P61201 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS2P61201 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS2P61201 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS2P61201 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COPS2P61201 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS2P61201 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS2P61201 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS2P61201 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS2P61201 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS2P61201 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS2P61201 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS2P61201 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS2P61201 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS2P61201 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS2P61201 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS2P61201 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS2P61201 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS2P61201 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS2P61201 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS2P61201 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS2P61201 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS2P61201 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS2P61201 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS2P61201 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS2P61201 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS2P61201 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS2P61201 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS2P61201 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS2P61201 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS2P61201 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS2P61201 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS2P61201 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS2P61201 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS2P61201 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS2P61201 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS2P61201 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS2P61201 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS2P61201 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS2P61201 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS2P61201 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS2P61201 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS2P61201 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS2P61201 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS2P61201 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS2P61201 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS2P61201 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms