Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD2BP57060 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms