Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL23P55773 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL23P55773 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL23P55773 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL23P55773 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL23P55773 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL23P55773 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL23P55773 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL23P55773 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL23P55773 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL23P55773 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL23P55773 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL23P55773 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL23P55773 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL23P55773 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL23P55773 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL23P55773 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL23P55773 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL23P55773 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL23P55773 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL23P55773 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL23P55773 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL23P55773 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL23P55773 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL23P55773 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL23P55773 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL23P55773 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL23P55773 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL23P55773 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL23P55773 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL23P55773 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL23P55773 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL23P55773 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL23P55773 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL23P55773 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL23P55773 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL23P55773 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL23P55773 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL23P55773 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL23P55773 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL23P55773 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL23P55773 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCL23P55773 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL23P55773 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL23P55773 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL23P55773 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL23P55773 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL23P55773 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL23P55773 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL23P55773 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL23P55773 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL23P55773 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL23P55773 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL23P55773 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL23P55773 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL23P55773 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL23P55773 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL23P55773 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL23P55773 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL23P55773 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL23P55773 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL23P55773 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL23P55773 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL23P55773 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL23P55773 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL23P55773 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL23P55773 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL23P55773 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL23P55773 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL23P55773 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL23P55773 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL23P55773 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL23P55773 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL23P55773 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL23P55773 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL23P55773 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL23P55773 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL23P55773 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL23P55773 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL23P55773 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL23P55773 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL23P55773 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL23P55773 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL23P55773 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms