Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	BMT2	YBR141C	1014 nt		4.01	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	XRS2	YDR369C	2565 nt		4.01	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	ERB1	YMR049C	2424 nt		4	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	RPB2	YOR151C	3675 nt		4	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	YER138W-A	YER138W-A	105 nt		4	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	PPE1	YHR075C	1203 nt		4	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	FMP46	YKR049C	402 nt		4	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	SED5	YLR026C	1023 nt		4	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	SEC72	YLR292C	582 nt		4	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	YLR363W-A	YLR363W-A	258 nt		4	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	RNA1	YMR235C	1224 nt		4	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	YBL107W-A	YBL107W-A	105 nt		4	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	IDH2	YOR136W	1110 nt		4	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	PET20	YPL159C	762 nt		4	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	YOL075C	YOL075C	3885 nt		4	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	YGL140C	YGL140C	3660 nt		4	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	GZF3	YJL110C	1656 nt		4	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	BCH2	YKR027W	2298 nt		4	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	MLH2	YLR035C	2088 nt		3.99	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	PPZ1	YML016C	2079 nt		3.99	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	RTS1	YOR014W	2274 nt		3.99	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	YCL068C	YCL068C	783 nt		3.99	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	YFR045W	YFR045W	930 nt		3.99	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	SOP4	YJL192C	705 nt		3.99	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	RPS10B	YMR230W	318 nt		3.99	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	PRX1	YBL064C	786 nt		3.99	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	RGS2	YOR107W	930 nt		3.99	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	RIT1	YMR283C	1542 nt		3.99	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	CEG1	YGL130W	1380 nt		3.99	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	NBP2	YDR162C	711 nt		3.98	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	YDR526C	YDR526C	471 nt		3.98	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	MMM1	YLL006W	1281 nt		3.98	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	SIC1	YLR079W	855 nt		3.98	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	YBL096C	YBL096C	309 nt		3.98	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	PNT1	YOR266W	1272 nt		3.98	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	INA17	YPL099C	549 nt		3.98	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	ICY2	YPL250C	411 nt		3.98	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	VPS69	YPR087W	321 nt		3.98	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	ZDS1	YMR273C	2748 nt		3.98	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	BOI2	YER114C	3123 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	AIM6	YDL237W	1173 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	RRG1	YDR065W	1098 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	YER076C	YER076C	909 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	BET1	YIL004C	429 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	EFB1	YAL003W	621 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	RSF1	YMR030W	1131 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	MTG1	YMR097C	1104 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	NIS1	YNL078W	1224 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	IBD2	YNL164C	1056 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	YOR314W	YOR314W	330 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	TFB6	YOR352W	1032 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	PNG1	YPL096W	1092 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	MGR2	YPL098C	342 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	FLO8	YER109C	2400 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	PHM7	YOL084W	2976 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	SPT6	YGR116W	4356 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	CHL1	YPL008W	2586 nt		3.97	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	ELO2	YCR034W	1044 nt		3.96	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	CLC1	YGR167W	702 nt		3.96	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	YML031C-A	YML031C-A	336 nt		3.96	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	MDJ2	YNL328C	441 nt		3.96	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	YAR1	YPL239W	603 nt		3.96	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	GDT1	YBR187W	843 nt		3.96	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	POL31	YJR006W	1464 nt		3.96	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	SWH1	YAR042W	3567 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	YCR016W	YCR016W	873 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	CTH1	YDR151C	978 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	RNH202	YDR279W	1053 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	ARI1	YGL157W	1044 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	YIL025C	YIL025C	375 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	GMH1	YKR030W	822 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	YAL069W	YAL069W	315 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	DCS1	YLR270W	1053 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	YLR311C	YLR311C	348 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	RUF20	RUF20	443 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	YNL162W-A	YNL162W-A	219 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	YOL038C-A	YOL038C-A	96 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	CYC2	YOR037W	1101 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	YPL088W	YPL088W	1029 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	TRM1	YDR120C	1713 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	SWI1	YPL016W	3945 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	PMT6	YGR199W	2280 nt		3.95	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	MSA1	YOR066W	1890 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	AVT7	YIL088C	1473 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	YCR015C	YCR015C	954 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	YDL186W	YDL186W	834 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	TRP4	YDR354W	1143 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	YJL028W	YJL028W	336 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	MRPS8	YMR158W	468 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	RPL18B	YNL301C	561 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	RPL18A	YOL120C	561 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	MUM2	YBR057C	1101 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	YPR142C	YPR142C	564 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	DPH6	YLR143W	2058 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	STB3	YDR169C	1542 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	MGR3	YMR115W	1506 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	TED1	YIL039W	1422 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	CMK1	YFR014C	1341 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	RRP14	YKL082C	1305 nt		3.94	□□□□□ -1.78
DSL1	P53847	TDA3	YHR009C	1572 nt		3.93	□□□□□ -1.78

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