Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACLYP53396 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACLYP53396 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACLYP53396 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACLYP53396 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACLYP53396 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACLYP53396 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACLYP53396 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACLYP53396 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACLYP53396 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACLYP53396 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACLYP53396 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACLYP53396 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACLYP53396 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACLYP53396 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACLYP53396 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACLYP53396 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACLYP53396 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACLYP53396 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACLYP53396 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACLYP53396 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACLYP53396 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACLYP53396 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACLYP53396 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACLYP53396 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACLYP53396 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACLYP53396 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACLYP53396 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACLYP53396 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACLYP53396 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACLYP53396 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACLYP53396 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACLYP53396 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ACLYP53396 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACLYP53396 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACLYP53396 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACLYP53396 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACLYP53396 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACLYP53396 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACLYP53396 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACLYP53396 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACLYP53396 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACLYP53396 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACLYP53396 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACLYP53396 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACLYP53396 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACLYP53396 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACLYP53396 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACLYP53396 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACLYP53396 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACLYP53396 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACLYP53396 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACLYP53396 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACLYP53396 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACLYP53396 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACLYP53396 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ACLYP53396 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ACLYP53396 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ACLYP53396 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACLYP53396 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACLYP53396 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ACLYP53396 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACLYP53396 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACLYP53396 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACLYP53396 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACLYP53396 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACLYP53396 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACLYP53396 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACLYP53396 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACLYP53396 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACLYP53396 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACLYP53396 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACLYP53396 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACLYP53396 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACLYP53396 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACLYP53396 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACLYP53396 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACLYP53396 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACLYP53396 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACLYP53396 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACLYP53396 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACLYP53396 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACLYP53396 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACLYP53396 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACLYP53396 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACLYP53396 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACLYP53396 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACLYP53396 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACLYP53396 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ACLYP53396 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACLYP53396 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACLYP53396 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACLYP53396 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACLYP53396 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACLYP53396 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACLYP53396 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACLYP53396 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACLYP53396 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACLYP53396 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACLYP53396 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms