Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST1P52848 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST1P52848 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST1P52848 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST1P52848 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST1P52848 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST1P52848 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST1P52848 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST1P52848 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST1P52848 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST1P52848 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST1P52848 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST1P52848 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST1P52848 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST1P52848 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST1P52848 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST1P52848 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST1P52848 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST1P52848 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST1P52848 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST1P52848 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST1P52848 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST1P52848 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST1P52848 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST1P52848 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST1P52848 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST1P52848 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST1P52848 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST1P52848 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST1P52848 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST1P52848 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST1P52848 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST1P52848 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST1P52848 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST1P52848 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST1P52848 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST1P52848 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST1P52848 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST1P52848 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST1P52848 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST1P52848 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST1P52848 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST1P52848 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST1P52848 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST1P52848 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST1P52848 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST1P52848 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST1P52848 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST1P52848 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST1P52848 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST1P52848 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST1P52848 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST1P52848 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST1P52848 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST1P52848 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST1P52848 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST1P52848 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST1P52848 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST1P52848 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST1P52848 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST1P52848 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST1P52848 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST1P52848 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST1P52848 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST1P52848 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST1P52848 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST1P52848 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST1P52848 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST1P52848 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST1P52848 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST1P52848 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST1P52848 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST1P52848 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST1P52848 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST1P52848 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST1P52848 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST1P52848 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST1P52848 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST1P52848 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST1P52848 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST1P52848 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST1P52848 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST1P52848 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms